Lulusan MTs dan MA Hidayatullah diharapkan memiliki karakter sebagai berikut:

1. Saliim al-‘aqiidah (memiliki aqidah dan visi hidup yang lurus berdasarkan Al-Quran dan Sunnah, sesuai pemahaman shahabat).
2. Mutsaqqaf al-fikr (memiliki ilmu yang mumpuni dalam bidang aqidah, syariah, dan sains).
3. Shahiih al-‘ibaadah wa matiin al-khuluq (mampu dan terbiasa beribadah dengan benar, serta berakhlak mulia sesuai tuntunan Rasulullah).
4. Qawiyy al-jism wa qaadir ‘alaa al- kasb (memiliki fisik yang kuat dan terlatih untuk bekal hidup mandiri).
5. Muhtamm bi amr al-muslimiin wa mujaahid li diinih (punya kepedulian akan nasib kaum muslimin dan berjuang demi agama-Nya di muka bumi).